慕尼黑機場終點站（德語：BahnhofMünchenFlughafen終點站）是慕尼黑機場的慕尼黑S-Bahn終點站，位於慕尼黑東慕尼黑機場鐵路盡頭。它通過S1和S8線連接到城市。乘車約45分鐘即可抵達市中心的Marienplatz車站。

慕尼黑機場站位於中心區域下方的隧道內。第二個站點Besucherpark（遊客公園）連接貨物和維護區域，長期停車場，行政大樓和名人訪客公園。

終端下方的第二條隧道目前尚未使用。最初，有計劃將其用於城際鐵路，然後使用Transrapid磁懸浮列車在10分鐘內到達慕尼黑中央火車站。但是，由於成本上升，該項目於2008年3月被取消。